Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Foxd4Q60688 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Foxd4Q60688 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms