Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sin3aQ60520 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sin3aQ60520 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms