Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Myh1Q5SX40 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms