Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Psme4Q5SSW2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Psme4Q5SSW2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms