Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sft2d1Q5SSN7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms