Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Phf12Q5SPL2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms