Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc85aQ5SP85 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms