Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc1Q5NCF2 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trappc1Q5NCF2 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms