Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim41Q5NCC3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms