Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccnl1Q52KE7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccnl1Q52KE7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms