Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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