Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm13299-201ENSMUST00000133644 425 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm13307-202ENSMUST00000142990 425 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm5149-202ENSMUST00000199980 1250 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm20052-201ENSMUST00000200831 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm43124-201ENSMUST00000201878 278 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm8679-201ENSMUST00000210651 1036 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm45276-201ENSMUST00000209549 1086 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Skap1Q3UUV5 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms