Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Tmem253Q3UNB8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms