Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Usp30Q3UN04 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp30Q3UN04 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms