Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrch2Q3UMG5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms