Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Nkx6-3Q3UHX8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Nkx6-3Q3UHX8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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