Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Puf60Q3UEB3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Puf60Q3UEB3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms