Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Parp8Q3UD82 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms