Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Cops9Q3U898 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms