Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Q3U6N9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms