Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rnf149Q3U2C5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Rnf149Q3U2C5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Rnf149Q3U2C5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rnf149Q3U2C5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
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