Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Q3U1D9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms