Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43aQ3TL54 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43aQ3TL54 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms