Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarca4Q3TKT4 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarca4Q3TKT4 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms