Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sppl2bQ3TD49 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sppl2bQ3TD49 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms