Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Itgb8Q0VBD0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Itgb8Q0VBD0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms