Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
TrioQ0KL02 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrioQ0KL02 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TrioQ0KL02 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TrioQ0KL02 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms