Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Znf541Q0GGX2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms