Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Pate4Q09098 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pate4Q09098 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms