Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Q08AU9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Q08AU9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Q08AU9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms