Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

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Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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F13bQ07968 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
F13bQ07968 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms