Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ddr1Q03146 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms