Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxd1Q01822 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxd1Q01822 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms