Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gbp1Q01514 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms