Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sec23aQ01405 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms