Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Top2aQ01320 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Top2aQ01320 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms