Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vgll3P85442 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vgll3P85442 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms