Protein–RNA interactions for Protein: P80316

Cct5, T-complex protein 1 subunit epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct5P80316 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cct5P80316 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cct5P80316 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms