Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux2P70298 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cux2P70298 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cux2P70298 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cux2P70298 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms