Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NficP70255 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NficP70255 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NficP70255 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NficP70255 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms