Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Traf5P70191 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Traf5P70191 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf5P70191 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Traf5P70191 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms