Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Acta2P62737 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms