Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Lmo4P61969 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Lmo4P61969 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms