Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hps5P59438 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hps5P59438 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms