Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
Csrnp3P59055 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csrnp3P59055 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms