Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Paxbp1P58501 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms