Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Usp5P56399 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms