Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc12a1P55014 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms