Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rad23aP54726 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms