Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cux1P53564 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cux1P53564 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms